La Auditoría Superior de la Federación (ASF) informó sobre observaciones por más de 8 mil 641 millones de pesos a la administración de Cuauhtémoc Blanco en Morelos, por presuntas irregularidades en el manejo de recursos federales. Uno de los puntos a destacar en el caso es que el monto por dichas irregularidades continúa ascendiendo, mientras que el Gobierno de Morelos no ha podido aclarar dónde terminaron los recursos.
En julio de 2024, la ASF indicó que la cifra ascendía a 3 mil 998 millones de pesos y, después, en octubre de 2025, actualizó que era de 5 mil 700 millones; hasta terminar en la cifra actual que asciende a más de 8 mil millones de pesos, de los cuales Morelos solo ha podido comprobar el destino de un millón de pesos correspondientes al erario público.
En las revisiones de la ASF se señaló que, durante el gobierno de Blanco, también exfutbolista profesional, se detectaron más de 185 anomalías en el manejo de recursos federales y que el dinero cuyo destino se desconoce provenía de 20 fondos, programas y subsidios federales diferentes que debieron ser aplicados en la entidad federativa.
Se señaló que las principales anomalías durante la administración de Blanco estuvieron concentradas en el Fondo de Aportaciones para la Seguridad Pública, así como en los subsidios municipales para el fortalecimiento del desempeño en materia de seguridad pública.
Debido a las anomalías que se encontraron en el manejo de los recursos públicos, la Fiscalía Especial de Morelos mantiene activas investigaciones administrativas y penales contra la administración encabezada por Cuauhtémoc Blanco, debido a las irregularidades en las secretarías de Desarrollo Agropecuario, Infraestructura y Desarrollo Económico.
A pesar de las investigaciones, no se ha judicializado ni se ha determinado la responsabilidad penal directa sobre Cuauhtémoc Blanco, quien además actualmente goza de fuero constitucional como diputado federal por Morena.
Sobre su administración en Morelos se han detectado diversas anomalías: en su primer año de gestión (2019) se encontró un desvío de dinero del Fondo de Aportaciones para la Seguridad Pública y en subsidios municipales para combatir a la delincuencia que opera en esa región. Posteriormente, se detectaron anomalías graves en el Fondo de Aportaciones para los Servicios de Salud, en el Programa para la Educación Tecnológica y en el Programa Nacional de Inglés.
Sin embargo, el año en el que más desvíos se detectaron fue en 2023, en el rubro de participaciones federales que se debían destinar a la realización de obras públicas en diversos municipios de la entidad federativa.